Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KR12 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3KR12 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3KR12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3KR12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3KR12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KR12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KR12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
J3KR12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3KR12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3KR12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3KR12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
J3KR12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms