Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC188H7C350 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC188H7C350 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC188H7C350 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms