Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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