Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BQF6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BQF6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BQF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BQF6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BQF6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BQF6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BQF6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BQF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BQF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BQF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BQF6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms