Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NPIPB9F8W1W9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPIPB9F8W1W9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms