Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms