Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
E9PCH4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
E9PCH4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
E9PCH4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
E9PCH4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
E9PCH4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
E9PCH4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
E9PCH4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
E9PCH4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
E9PCH4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
E9PCH4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
E9PCH4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
E9PCH4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
E9PCH4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
E9PCH4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
E9PCH4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
E9PCH4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
E9PCH4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
E9PCH4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
E9PCH4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
E9PCH4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
E9PCH4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
E9PCH4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
E9PCH4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
E9PCH4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
E9PCH4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
E9PCH4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
E9PCH4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
E9PCH4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
E9PCH4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
E9PCH4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
E9PCH4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
E9PCH4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
E9PCH4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
E9PCH4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
E9PCH4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
E9PCH4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
E9PCH4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
E9PCH4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
E9PCH4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
E9PCH4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
E9PCH4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
E9PCH4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
E9PCH4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
E9PCH4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
E9PCH4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
E9PCH4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms