Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSBP1L1C9JCN9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms