Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms