Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRM3A6NNA2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms