Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6BA6NDN3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6BA6NDN3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms