Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSAPA4D1B5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms