Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf170A2RU37 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms