Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPDC1A2A3K4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPDC1A2A3K4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms