Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIEF1-203ENST00000404569 3797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MARCH7-209ENST00000539065 3303 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 COG1-210ENST00000618996 3369 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 STAT6-220ENST00000556155 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FCRLA-214ENST00000546024 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HOPX-211ENST00000554144 1672 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HAUS8-203ENST00000593360 3176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SVEP1-201ENST00000374461 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TCP11L1-202ENST00000432887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZFP37-202ENST00000553380 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NR1I2-201ENST00000337940 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC002519.1-201ENST00000570073 2792 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GRIK1-204ENST00000399907 3472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ALS2CL-203ENST00000415953 3471 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RSPH10B-208ENST00000539903 2881 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ADAMTS7P3-201ENST00000566116 3716 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 SLC22A8-210ENST00000545207 1622 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC008764.9-201ENST00000624284 2505 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 TNFRSF9-201ENST00000377507 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PRAMEF18-202ENST00000624297 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MAMLD1-205ENST00000432680 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LSAMPQ13449 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms