Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL139274.2-201ENST00000606274 4127 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC080112.4-201ENST00000623156 2491 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRMT10B-201ENST00000297994 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KIF18BP1-201ENST00000567585 2264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM92A-206ENST00000518322 4241 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP21-203ENST00000396432 7167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HOPX-211ENST00000554144 1672 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZER1-201ENST00000291900 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ARMC8-201ENST00000358441 3181 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NEFL-201ENST00000610854 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF423-205ENST00000562871 4514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MYBPC3-201ENST00000256993 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MYBPC3-202ENST00000399249 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ADAM22-201ENST00000265727 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PHB-214ENST00000614445 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NOD1-201ENST00000222823 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC01429-201ENST00000438154 2326 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL590434.1-201ENST00000641402 1886 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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