Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC01442-202ENST00000618872 1600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL590683.1-201ENST00000439059 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 LMCD1-202ENST00000397386 1501 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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