Protein–RNA interactions for Protein: P33778

HIST1H2BB, Histone H2B type 1-B, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2BBP33778 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ZNF548-201ENST00000336128 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PIWIL2-202ENST00000454009 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 UST-201ENST00000367463 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CELF5-203ENST00000541430 4268 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CNTN2-232ENST00000640428 4146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 LMO3-215ENST00000537304 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ZNRD1ASP-212ENST00000420251 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 GAPDHP67-201ENST00000422905 788 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 AC010307.3-202ENST00000515122 3142 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PHF21B-212ENST00000629843 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 NOP2-203ENST00000399466 2701 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HIST1H2BBP33778 OR11A1-204ENST00000641152 2440 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 PAK3-204ENST00000372010 2606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 GOLGA8EP-202ENST00000620011 5241 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 UPK1B-201ENST00000264234 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 GRM8-203ENST00000358373 3850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 TTC12-210ENST00000483239 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 ALDH8A1-201ENST00000265605 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 RHO-201ENST00000296271 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 S100PBP-202ENST00000373475 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 LINC00689-201ENST00000413238 4684 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 AP3B2-201ENST00000261722 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIST1H2BBP33778 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms