Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HYPK-203ENST00000458412 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MYT1-205ENST00000622439 2140 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 BANF1P4-201ENST00000420029 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LYPLA1P2-201ENST00000513113 691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PAX5-209ENST00000520154 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MEG8_1.1-201ENST00000617245 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC011591.2-201ENST00000636637 786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HSD3B2-201ENST00000369416 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 C11orf1-201ENST00000260276 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 OR2B11-201ENST00000318749 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MAPT-202ENST00000334239 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 RPL15P3-201ENST00000391491 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PHKG1P4-201ENST00000430144 370 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 LINC02105-201ENST00000504552 1003 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 GFRA2-203ENST00000517892 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC114321.1-201ENST00000520075 533 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC100793.3-201ENST00000592440 719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 BPIFA1-204ENST00000618484 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CYP17A1-205ENST00000638272 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 CD160-201ENST00000235933 1425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIRT1Q96EB6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms