Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 IGHV3-74-201ENST00000424969 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 UBTFL5-201ENST00000443682 1191 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 FRMD6-204ENST00000553556 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms