Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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