Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQV3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQV3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQV3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
U3KQV3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQV3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQV3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
U3KQV3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
U3KQV3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
U3KQV3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms