Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SERP1Q9Y6X1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SERP1Q9Y6X1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms