Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1Q9Y6S9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms