Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A4Q9Y6R1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms