Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00312Q9Y6C7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms