Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX13Q9Y5W8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SNX13Q9Y5W8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX13Q9Y5W8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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