Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFRSF18Q9Y5U5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms