Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms