Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIF3AQ9Y496 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIF3AQ9Y496 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms