Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3KQ9Y2Y1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3KQ9Y2Y1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3KQ9Y2Y1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3KQ9Y2Y1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3KQ9Y2Y1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR3KQ9Y2Y1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR3KQ9Y2Y1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms