Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP3Q9Y2W7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms