Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms