Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2BQ9Y287 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms