Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms