Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIPT1Q9Y234 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LIPT1Q9Y234 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms