Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HHLA3Q9XRX5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms