Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNNQ9UQP3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNNQ9UQP3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms