Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC8A2Q9UPR5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC8A2Q9UPR5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms