Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms