Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4E1Q9UPM8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4E1Q9UPM8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms