Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLA2G4CQ9UP65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLA2G4CQ9UP65 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms