Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML1Q9UN30 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCML1Q9UN30 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms