Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TSR3Q9UJK0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSR3Q9UJK0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms