Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms