Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAX2Q9UIW0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms