Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS51Q9UID3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS51Q9UID3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS51Q9UID3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms