Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A2Q9UI40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A2Q9UI40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A2Q9UI40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A2Q9UI40 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC24A2Q9UI40 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC24A2Q9UI40 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC24A2Q9UI40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms