Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX25Q9UHL0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms