Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NPC1L1Q9UHC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms